Stando alle attestazioni più antiche, risalenti al 1275, nasce probabilmente come cappella per dare un minimo di risposta alle esigenze religiose degli abitanti di Monte Fontegiano. La chiesa attuale venne edificata forse sopra l’edificio preesistente e sembra risalire al XIV sec., sia per la struttura interna, sia da quanto rimane dell’affresco dietro l’altare raffigurante la Crocefissione e da altri frammenti sulle pareti laterali e posteriori, di notevole fattura.

Sopra l’ingresso, quattro mattonelle di maiolica compongono l’immagine di Sant’Andrea e recano la data 1608.